Third-Generation-Sequencing: Chancen für die Transfusionsmedizin
Dr. rer. nat. Martina Führer
Wissenschaftliche Mitarbeiterin
Abteilung für Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie
und Experimentelle Transplantation, Institut für Klinische
Transfusionsmedizin und Immungenetik (IKT) Ulm
Dr. biol. hum. Rebekka Waldmann
Wissenschaftliche Mitarbeiterin
Abteilung für Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie
und Experimentelle Transplantation, Institut für Klinische
Transfusionsmedizin und Immungenetik (IKT) Ulm
Annika Vogt, M.Sc
Wissenschaftliche Mitarbeiterin
Abteilung für Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie
und Experimentelle Transplantation, Institut für Klinische
Transfusionsmedizin und Immungenetik (IKT) Ulm
Vincent Kramer, M.Sc.
Biotechnologe
Abteilung für Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie
und Experimentelle Transplantation, Institut für Klinische
Transfusionsmedizin und Immungenetik (IKT) Ulm
Timo Dinse, B.Sc.
Biotechnologe
Institut für Transfusionsmedizin,
Universitätsklinikum Ulm
Dr. med. Christof Weinstock
Abteilungsleiter
Abteilung für Immunhämatologie und Blutgruppenserologie,
Institut für Klinische Transfusionsmedizin
und Immungenetik (IKT) Ulm
Prof. Dr. med. David Messerer, MME, MHBA
Abteilungsleiter
Abteilung für Molekulare Diagnostik, Molekulare Therapie
und Experimentelle Transplantation, Institut für Klinische
Transfusionsmedizin und Immungenetik (IKT) Ulm
Zusammenfassung
Third-Generation-Sequencing (TGS) eröffnet neue Perspektiven für die molekulargenetische Diagnostik in der Transfusionsmedizin. Im Vergleich zu klassischen serologischen und molekulargenetischen Technologien ermöglicht TGS eine genauere Blutgruppen- und HLA-Typisierung sowie die Identifizierung komplexer Haplotypen und struktureller Varianten. In der Pathogendetektion erlaubt TGS perspektivisch eine umfassende, weitgehend biasfreie Analyse mikrobieller Genome und die verbesserte Rückverfolgung transfusionsassoziierter Infektionen mit spannenden Anwendungsfällen im Bereich der Resilienz gegenüber Pandemien und Bioterrorismus. Dieser Beitrag skizziert TGS als zukunftsweisende Plattformtechnologie, erläutert Funktionsweise, Vorteile, Limitationen und zentrale Herausforderungen.
Third-generation-sequencing (TGS) opens new perspectives for molecular genetic diagnostics in transfusion medicine. Compared to classical serological and molecular genetic technologies, TGS enables more accurate blood group and HLA typing as well as the identification of complex haplotypes and structural variants. In pathogen detection, TGS offers the potential for comprehensive, mostly bias-free analysis of microbial genomes and improved tracing of transfusion-associated infections, with exciting applications in the context of resilience to pandemics and bioterrorism. This article outlines TGS as a forward-looking platform technology, highlighting its mechanisms, advantages, limitations, and key challenges.